Los climas existentes en el municipio son: Cálido húmedo con lluvias todo el año (67.78%) y Semicálido húmedo con lluvias todo el año (32.22%).

En los meses de mayo a octubre, las temperaturas mínimas promedio se distribuyen porcentualmente de la siguiente manera: de 12 a 15°C (27.27%), de 15 a 18°C (69.56%) y de 18 a 21°C (3.17%). En tanto que las máximas promedio en este periodo son: De 21 a 24°C (0.93%), de 24 a 27°C (73.01%), de 27 a 30°C (25.28%) y de 30 a 33°C (0.78%).

Durante los meses de noviembre a abril, las temperaturas mínimas promedio se distribuyen porcentualmente de la siguiente manera: de 6 a 9°C (3.31%), de 9 a 12°C (77.24%), de 12 a 15°C (17.9%) y de 15 a 18°C (1.54%). Mientras que las máximas promedio en este mismo periodo son: De 18 a 21°C (65.08%), de 21 a 24°C (30.07%), y de 24 a 27°C (4.86%).

En los meses de mayo a octubre, la precipitación media es: de 1700 a 2000 mm (9.15%), y de 2000 a 2300 mm (90.85%). En los meses de noviembre a abril, la precipitación media es: de 1000 a 1200 mm (46.55%), de 600 a 700 mm (0.23%), de 700 a 800 mm (12.59%) y de 800 a 1000 mm (40.62%).

El municipio se ubica dentro de las subcuencas R. Tzimbac y R. Zayula que forman parte de la cuenca R. Huixtla y Otros, y las subcuencas P. Netzahualcóyotl, forma parte de la cuenca R. Grijalva - Tuxtla Gutiérrez.

Las principales corrientes de agua en el municipio son: Arroyo Tombac, Río Cuachi, Río Napac, Río Tzimbac, Arroyo Zachabaná y Arroyo El Limón.